Czy istnieje w C++ funkcja podobna do eval() w php? Jeśli tak, to w jakiej bibliotece?

Nie ma -- bo C++ jest kompilowany.

ale podobny efekt możesz uzyskać pisząć np. system obsługi wtyczek w jakimś języku, np. pythonie (który z resztą został pierwotnie napisany w takim właśnie celu). To wcale nie jest tak trudne i nie wymaga aż tak dużo pracy, jakby się mogło wydawać, ponieważ interfejs jest już gotowy (Python.h), trzeba tylko skorzystać.