1. Jak optymalnie zbudować bazę mysql, dla czatu? Istnieją jakieś sprawdzone sposoby? Chodzi mi o samą budowę bazy, wysyłania odczytu wiadomości i np. widocznych tylko do 60 wysłanych, po czym resztę starszych są wysyłane do "archiwum" aby nie przeiąrzać bazy. [pomijam tu ajax]
2. Na jakiej zasadzie działa opcja chowania kategorii np. na takim forum http://unisolutions.pl/ ? Jest to JS który wysyła/zapisuje ciasteczka?
3. Czy jeśli zmienię nazwy tabel w bazie która działa już dośc długo i ma sporo rekordów to czy wpłynie to na jej wydajność? Coś z wiazanego z indeksowaniem itp.?

Jkabyście mieli jakieś tutoriale, przykłady to prosiłbym o linki w tych dziedzinach, chętnie bym obadał jakiś kod pod tym względem.

google.pl ( bez złośliwości )
http://www.softmania.pl/programy-kategoria-14-chat.html#m pobierz sobie i zobacz jak ktos juz to zrobił.
Pamiętaj że dobry programista to leniwy programista kradnij pomysły

Google ma tą wadę że Ci nie opowie o swoich doświadczeniach itp. a forum nadaje się do tego idealnie.