Tak ustawiam w swoim Bootstrap'ie ścieżke inkludowania:

[PHP] pobierz, plaintext 
<?php
set_include_path(
            get_include_path() . PATH_SEPARATOR . 
            APPLICATION_PATH . '/../library/' . PATH_SEPARATOR . 
            APPLICATION_PATH . '/models'
        );
?>
[PHP] pobierz, plaintext 

Jak tylko wprowadziłem moduły, pojawił się problem - każdy moduł ma swój folder z modelami (application/modules/nazwa_modułu/models/).
Jak w takim przypadku mogę ustawić ten include_path?
Podobnie się ma sprawa z kontrollerami i widokami.

Możesz dodać tyle ścieżek ile masz modułów. Jednak jest to bardzo złe rozwiązanie. Bardzo szybko padnie Ci wydajność.
A po co Ci te ścieżki w include_path? Jeśli tylko po to, by automatycznie ładować klasy, to szkoda wydajności. Wymagane klasy możesz dołączać poprzez require_once.
Jeśli chcesz, by Twoje moduły były widoczne, wystarczy, że użyjesz funkcji addModuleDirectory, wywołaną na obiekcie front controllera (najlepiej w pliku bootstrap).

Z tego co widzę, kontrollery do poszczególnych modułów Zend sam znajduje, co do widoków mam obiekt $request w pluginie ViewSetup który integruje mi PHPTAL'a (system szablonów) z Zendem, a w nim zmienną module - nazwę aktualnego modułu, więc tam z ustawieniem ścieżek do templaków nie ma problemu

[PHP] pobierz, plaintext 
<?php
class My_Controller_Plugin_ViewSetup extends Zend_Controller_Plugin_Abstract
{
public function dispatchLoopStartup (Zend_Controller_Request_Abstract $request){
....
        $view->addScriptPath(APPLICATION_PATH . '/modules/' . $request->module . '/views/templates')
             ->doctype('XHTML1_STRICT');
 
        $viewRenderer->setView($view)
                     ->setViewSuffix('xhtml')
                     ->init();
 
        // setup Zend_Layout
        Zend_Layout::startMvc(array(
            'layoutPath' => APPLICATION_PATH . '/modules/' . $request->module . '/views/layouts',
             'layout' => 'main' ,
             'viewSuffix' => 'xhtml'
        ));
....
}
}
?>
[PHP] pobierz, plaintext 

Co do modułów chyba własnie najlepiej ręcznie requirować je, dzięki za pomoc ;-)