Mam firmy w tabeli. [id, nazwa_firmy]
Posiadają one godziny otwarcia w osobnej tabeli. (id_firmy, id_dzien, od, do)

Chciałbym sortować zaczynając od firm które mają najwięcej czasu do zamknięcia a potem firmy które mają najmniej czasu do otwarcia. Nie mam pojecia jak to rozgryźć i jeszcze jak mi dojdzie tabela wyjatkow, zastanawiam sie czy jest to mozliwe do skonstruowania z poziomu zapytania czy raczej powinienem kombinować to zrobić najpierw za pomocą skryptu php ?

W jakim formacie zapisane masz godziny? Problem wydaje się być prosty do rozwiązania

w formacie "10:30:00"

[SQL] pobierz, plaintext 
SELECT 
     p.id
FROM 
     sklep AS s
     LEFT JOIN produkt AS p ON (p.id_sklep = s.id_sklep)
WHERE
     s.id_sklep > 5
ORDER BY p.id DESC, s.id_sklep ASC
[SQL] pobierz, plaintext 

Mam nadzieję, że załapiesz o co chodzi - a jak nie to odsyłam do googla pod hasłami "mysql ORDER BY" i "mysql JOIN"

Potrzebujesz trzy informacje na temat każdej firmy:
1. Czy firma jest aktualnie otwarta (czyli czy aktualny czas mieści się pomiędzy wartościami OD i DO dla danego dnia)
2. Czas do zamknięcia (różnica pomiędzy DO a aktualnym czasem)
3. Czas do otwarcia (różnica pomiędzy północą a aktualnym czasem + różnica pomiędzy OD a północą + 24h za każdy pełen dzień w którym firma nie pracuje, np. jeśli aktualnie jest piątek 20:00, a firma będzie otwarta w poniedziałek o 6:00, to ma ci wyjść: 4h + 2*24h + 6h) – ten punkt prawdopodobnie będzie najtrudniej napisać

Następnie dla otwartych firm sortujesz po wartości wyliczonej w punkcie 2., a dla zamkniętych po wartości wyliczonej w punkcie 3. (używając w tym celu konstrukcji CASE w ORDER BY)