Jak chcesz wywalić te pliki, to musisz podłączyć czytnik do komputera przez USB i usunąć je ręcznie.
Z tego, co wiem, synchronizować pliki z Amazona za darmo można tylko poprzez połączenie WiFi. Nie chciało mi się w to bawić, bo wygląda na to, że Amazon Kindle nie potrafi łączyć się z sieciami z zabezpieczeniami WPA2-PSK i nie chciałem sobie specjalnie przekonfigurowywać routera tylko po to, żaby mi się Amazon Kindle podłączył.
Najprościej wrzucać ebooki przez USB. Mój Kindle czyta standardowe formaty ebooków (*.mobi, *.pcr i inne), ale potrafi też czytać pdf-y, choć odczyt jest wtedy niższej jakości, ale w niektórych sytuacjach warto z tego skorzystać.
Dodatkowo, przydatne narzędzia do konwersji plików tekstowych na format ebooków, to Calibre i Mobi Pocket Creator. Fajny sklep z polskimi (choć nie tylko) ebookami:
http://nexto.pl Tyle na razie w temacie.