Kilka dni już walczę z problemem, jednak bezskutecznie, może ktoś tutaj mnie nakieruje

Po przełączeniu serwera z FCGI na uWSGI przestał działać .htaccess
Działa w katalogu głównym, tzn w tym w którym jest umieszczony, ale nie ma kompletnie wpływu na podkatalogi.
Zawartość .htaccess-a:
Options -Indexes RewriteEngine on RewriteBase / RewriteRule ^([a-zA-Z0-9\_\-\/]+)(.php|.htm|.html)?$ index.php?m=$1.php [L,QSA]
Ogólnie rzecz biorąc, jeśli w htaccessie wpiszę jakieś głupoty, to w katalogu głównym pojawi się Internal Server Error, ale w podkatalogach już nie. No i dodam że podkatalogi swoich htaccessów nie mają.
Będę wdzięczny za jakiekolwiek sugestie
