Przykładowo mam taki kodzik:

[HTML] pobierz, plaintext 
<script LANGUAGE="JavaScript">
if(confirm('Czy na pewno chcesz?'))
{
var mojaZmienna = 1;
}
else
{
var mojaZmienna = 0;
}
</SCRIPT>
[HTML] pobierz, plaintext 

pytanie: jak wykorzystać zmienna mojaZmienna dalej w skrypcie php?

Człowieku, zastanów się nad kolejnością!
Masz skrypt php, skrypt ten generuje ci kod html i skrypt javascript. dalej cały ten szajs leci do przeglądarki, która zaczyna wykonywać (po załadowaniu strony) skrypt javascript. Natomiast serwer przestał wykonywać skrypt php przed wysłaniem go do przeglądarki.
Tak więc możesz te zmienne wysłać ale już do innego skryptu (nawet tego samego, ale) takiego, który wykona się później (GET, POST).

Opiszę swój problem, jest formularz z zamówieniem terminu, user zamawia i skrypt sprawdza, czy ten dzień juz jest zajęty, jeżeli jest zajęty, to pyta się usera, czy chce, aby został dodany do listy rezerwowej, jeżeli user chce, to dodaję go do listy rezerwowej a jak nie, to wybiera inną datę. Pomyślałem, że rozwiążę to za pomoca javascriptu jak wyżej. Masz inny pomysł?

ajax, polecam obiekt advAjax
http://advajax.anakin.us/