Baza co prawda jest na serwerze w ktalogu root/baza.sql.gz, ale bazy ogólnie mam w innym katalogu
i mają rozszerzenia w stylu .MYI .MYD
Baza zajmuje kilkaset Mb, dlatego nie idzie jej importować za pomocą phpmyadmina.
Jak w takim razie zrobić z tego pliku w pełni działającą bazę ?

Jeśli masz dostęp do konsoli to chyba najlepiej w ten sposób.
Tu masz więcej informacji: http://www.witer.net/aktualnoci/84-mysql/2...soli-mysql.html

Czyli:

[SQL] pobierz, plaintext 
mysql> USE nazwa_bazy;
mysql> source plik_sql;
[SQL] pobierz, plaintext 

To załatwi sprawę ?
A jeśli plik sql jest w formacie sql.gz to też można go załadować, czy trzeba go najpierw rozpakować ?

Tak, to zadziała, oczywiście po połączeniu z serwerem.
W formacie sql.gz też pójdzie, nie musisz rozpakowywać.