Zakładam, że te moduły są utworzone w katalogu określonym przez standardowy wpis konfiguracyjny w application.ini:
Kod
resources.frontController.moduleDirectory = APPLICATION_PATH "/modules"
więc możesz sobie nawet tą informację wyciągnąć z tego pliku (załadować go do Zend_Config_Ini. $config->resources->frontController->moduleDirectory i przeskanować folder).
Ale istnieje zwykle lepsze rozwiązanie, możliwe do zastosowania gdy bootstraping zasobu frontController już się zakończył, bo wówczas tablicę absolutnych ścieżek do katalogów z modułami pobierzesz z:
$modules = Zend_Controller_Front::getInstance()->getDispatcher()->getControllerDirectory();
Ściśle mówiąc, to działa, jeśli front controller używa swoje domyślnego dispatchera Zend_Controller_Dispatcher_Standard - czyli zawsze, jeśli nie ustawiłeś jakiegoś własnego

PS. po co Ci to? czy chcesz to wiedzieć, aby zrobić automatyczny autoloading klas z tych modułów? tak z ciekawości pytam, bo jak robiłem taki autoloading, to potrzebowałem tej właśnie informacji o modułach