Mam stronę na której w divie wczytywana jest strona uploadujący pliki. Po wgraniu pliki div ten się odświeża i pokazuje załadowane pliki. Wszystko ładnie tylko, że w IE zamiast odświeżenia diva to on tak jakby dodaje ładowaną treść pod już istniejącą.

Nie wiem który kawałek kodu może za to odpowiadać ale najpewniej będzie to:

[HTML] pobierz, plaintext 
function ajaxFileUpload()
	{
		$("#loading")
		.ajaxStart(function(){
			$(this).show();
		})
		.ajaxComplete(function(){
			$(this).hide();
		});
 
		$.ajaxFileUpload
		(
			{
				url:'doajaxfileupload.php',
				secureuri:false,
				fileElementId:'fileToUpload',
				dataType: 'json',
				success: function () {
					$("#zdjecia").load("ajaxfileupload.php");
					$("#fileToUpload").val('');
				}
			}
		)		
		return false;
}
[HTML] pobierz, plaintext 

Dodatkowo jest tak, że przy przeładowaniu tego diva tracą się polskie znaki, mimo że jest ustawione kodowanie.

Jednak w komunikacji javascript -> serwer znacznie lepiej sprawdza się json, w php masz gotową funkcję: json_encode

load() jest znane z tego, że nie działa pod wszystkimi przeglądarkami.

Ale mówisz tylko o kodowaniu znaków?
A jest może jakaś funkcja zastępcza? Widzę, że często wykorzystują html() ale z tego co widzę, to ona wyświetla to co ma w nawiasie czyli np. wyświetla blabla.php zamiast ładować jego treść.

Mam na myśli ogólne korzyści wynikające z używania JSON, np. łatwość obróbki danych, w jQuery przede wszystkim. A co do kodowania, to druga sprawa dlatego podałem Ci funkcję.

Osobiście przebudowuję swój serwis tak, aby korzystał z JSON. Jest lekki, wszystko obrabiam javascript - im mniej danych tym szybciej strona zostanie pobrana przez użytkownika.