Dociągnął mi się jakiś update do svn i nagle przestało działać zaznaczanie zmian w projekcie połączonym z repozytorium.
Ani drobna modyfikacja ani nowy plik nie ma innej ikonki tylko cały czas tak jakby nie byłoby zmian.

Ktoś wie o co może chodzić ? Czy to można jakoś włączyć ?

Sprawdź przełączając się w perspektywę SVN czy masz zdefiniowane wcześniej lokalizacje repozytoriów, możliwe, że te ustawienia zostały utracone wskutek aktualizacji. Sprawdź jeszcze svn status w terminalu. W ostateczności zrób backup całego kodu, pozbądź się ukrytych folderów .svn w kopii, usuń oryginalny folder główny i zrób ponownie svn checkin.