Mam taki kod:

[HTML] pobierz, plaintext 
<a href="/userfiles/20141023_113942_780831.jpg" download="Zdjęcie.jpg"> Pobierz</a>
[HTML] pobierz, plaintext 

W chrome działa bez problemu plik.
Natomiast w ie zamiast pobrać plik to otwiera go w nowym oknie.......... Jak temu zaradzić?

Czytałeś? http://www.w3schools.com/tags/att_a_download.asp
Powinieneś do zrobić poprzez PHP, tj. pobrać plik w skrypcie i wymusić download.

A jak to zrobić za pomocą jquery? żeby działało w ie?

Zapytaj kolesia tutaj:
http://forum.php.pl/index.php?showtopic=23...p;#entry1129344
ma bardzo podobny problem