Dzisiaj chciałbym zapytać, jak podejść do tematu wyboru ścieżki zapisu przez użytkownika, bo szukałem w googlach, ale słabo widocznie szukałem. Da się w ogóle takie coś w php osiągnąć?

Ale ścieżki zapisu czego? Wrzucanych przez użytkownika plików na serwer?

Chodzi Ci o ścieżkę, w której zapisujesz pliki uploadowane do skryptu? Jeśli tak, to najpierw wskakują one do katalogu, który masz ustawiony w php.ini pod upload_tmp_dir, później trzeba je przenieść.
Przenieść je możesz w dowolne miejsce do którego masz uprawnienia więc możesz sobie śmiało wybierać 'ścieżkę zapisu przez użytkownika';

np użytkownik uploaduje pliki, a potem chce je spakować do zipa, więc chcę mu dać możliwość wyboru - gdzie zapisać paczkę zip

http://php.net/manual/en/zip.examples.php tutaj masz przykłady jak zrobić archiwum zip. A w jakim pliku je zrobisz to już Twoja sprawa. Mozesz nawet sciezke postem/getem przesylac.

archiwum tworzę, ale kwestię ścieżki chcę dać użytkownikowi do wyboru, pomyślę nad postem/getem, ale bardziej zastanawiam się, czy jest możliwość jakiegoś okienka, gdzie użytkownik chodzi i klika zapisz w odpowiedniej lokalizacji i ona pobierana jest do zmiennej

Pewnie, że jest. Trzeba tylko sobie to napisać. W sumie to listowanie zawartosci katalogu + przesylanie ajaxem + troche JS'a i bedzie smigać. Aczkolwiek raczej dziwne rozwiazanie. Zazwyczaj sie nie pozwala userowi latać po dysku i sprawdzac zawartosci

tylko chodzi o to, że tworzę generator, a użytkownik za jego pomocą tworzy szablon i wtedy chcę dać mu możliwość, by ten szablon spakował sobie do zip i zapisal u siebie, tam gdzie chcę, ale teraz się troszkę przeraziłem

U siebie? Przecież za to gdzie u niego się to zapisze odpowiada przeglądarka.

no to zapiszę to na serwerze i zrobię przycisk do pobierania i tyle