Czy ktoś wie w jakim stopniu można wykorzystać php. Czy można np wykonywać operacje administracyjne na serwerze z innego komputera.

Słyszałem o takim narzędzi jak CPanel niesety nie dotarłem do żadnych informacji na ten temat. Czy ten program jest oparty na php.

Lub czy istnieje już gotowy program do pracy na serwerze przez internet np. przez przeglądarkę?

php posiada funkcje exec() i podobne do wykonywania polecen systemowych, wiec wszystko co mozesz zrobic na serwerze z linii komend mozesz tez zrobic za pomoca php, "wsytarczy" napisac odpowiedni interfejs przegladarkowy.

CPanel -- nie mam o nim pojecia.