Witam, czy jest możliwość sprawdzenia ile dany użytkownik (który jest zapisany w mysql) pobrał w sumie MB ?

Jasne, że jest taka możliwość, wystarczy dodać nowe pole w bazie danych, a później robić update przy każdym pobranym pliku przez danego użytkownika.

a jak nie pobierze całego pliku tylko przerwie w połowie ?

Tzn. tak jak Ty mówisz to się chyba nawet nie się nie da zrobić. Chodzi mi o to, że po kliknięciu zalogowanego użytkownika w link do pliku, skrypt robi update do bazy, zwiększając jego ilość pobranych danych o rozmiar pliku. Później po prostu pobierasz wartość z bazy i wyświetlasz.

Jeśli będziesz obsługiwał pobieranie plików przez usera za pomocą php (fsockopen, fwrite) i użyjesz

[PHP] pobierz, plaintext 
ignore_user_abort(true);
set_time_limit(0); 
[PHP] pobierz, plaintext 

to efekt osiągniesz poprzez zapisanie ilości pobranych danych po tym jak socket zacznie być błędny (tj user sobie pójdzie) lub plik się skońćzy.


Edit:
@emajl22 - uwierz mi, nie ma rzeczy której w php się NIE DA zrobić