Hej!
Piszę właśnie prosty czat przy użyciu php i ajax i chciałbym tak zmodyfikować czat aby maksymalnie mogły siedzieć na nim dwie osoby, a żeby były dla nich widoczne rozmowy tylko które przeprowadzili między sobą. Jakieś pomysły jak to zrobić?

Tak - skorzystaj z SQL'a

Do tabeli gdzie masz wiadomości, dodajesz jeszcze jedno pole które powiedzmy nazwiesz sobie "room", i w ten sposób możesz sobie symulować "pokoje" i już po stronie skryptu sprawdzać ile jest osób, i odrzucać użytkowników którzy chcą wejść do przepełnionego pokoju. Czyli dwie tabele: rooms, messages. W rooms trzymasz ID, powiedzmy nazwę i ilość osób przebywających w danym pokoju. W messages trzymasz ID, treść wiadomości, room_id i user_id. Tak mniej więcej mogłoby to wyglądać.