Cześć,
z bazy danych pobieram ilość energii gracza tak wygląda:

[PHP] pobierz, plaintext 
Energia: 100 /100
[PHP] pobierz, plaintext 

Chcę, żeby gdy pobrany poziom energii jest mniejszy niż np. 50 to automatycznie się regeneruje np. co 5 minut 2 jednostki. Jak coś takiego zrobić? Ma ktoś jakiś ciekawy pomysł?

Najwygodniej byłoby zrobić crona, który wszystkim graczom zwiększałby odpowiednio energię co 5 minut.

Ewentualnie sprawdzasz status kiedy była ostatnia regeneracja (timestamp) i odejmujesz aktualny od ostatniego i dzielisz na 600 (5 minut) i masz ile regeneracji pominiętych, po czym aktualizujesz timestamp z ostatnią regeneracją.
Oczywiście jest to tylko zarys, bo jeszcze dochodzi aktualizacja timestampa jeśli energia spada poniżej 50, itp.

Przykładowo:
if($sql['energia']<50){ +2 dla $sql['energia'] }
Później podczepiasz Cron'a, który odpala taki plik co 5min