ściągnij sobie starszą wersję SQLite Manager'a do mozilli (miałem reinstalkę i teraz ściągnąłem żeby dać Ci odpowiedź ale... jest nowsza wersja newet z definicją własnych funkcji - akurat pod mozillą to w js...)...
w starszej wersji był zawsze komunikat, że alter nie do końca jest zaimplementowane oraz dosyć niebezpieczne dla bazy i wyświetlona była komenda z zapytaniem SQL...
generalnie polegało to na kopiowaniu tabeli do tabeli tymczasowej, drop tabeli głównej i utworzenie jej od nowa z tymczasowej z modyfikacjami po czym drop tymczasowej - czyli kopiuj do tymczasowej nawet może już przystosowanej, kasuj główną i odtwórz główną, kasuj tymczasową...
edit...
a tak sobie wróciłem do tego tematu bo po niewczasie przypomniałem sobie, że komunikat był przy czym innym ;p - sorka ;p
za to gotowe rozwiązanie:
CREATE TABLE "main"."test" ("id" INTEGER PRIMARY KEY NOT NULL ,"k1" INTEGER,"k2" TEXT,"k3" TEXT);
INSERT INTO "main"."test" SELECT *, NULL AS "k3" FROM "main"."__temp__test";
DROP TABLE "main"."__temp__test"
gdzie bazowa tabela to:
CREATE TABLE "main"."test" ("id" INTEGER PRIMARY KEY NOT NULL ,"k1" INTEGER,"k2" TEXT);
i w powyższym dodało się kolumne