Czy istnieje jakaś funkcja dzięki której mogę ustawić nową, czystą sesję z nowym id ?

Nowe id możesz uzyskać używając session_regenerate_id(true) i unset(zmienna) dla czyszczenia zmiennych

session_regenerate_id

problem w tym, że session_regenerate_id(true) nie usuwa starej sesji.
Czyli najlepiej unset i regenerate ?
Nie ma innej opcji dla zachowania starej sesji i stworzenia nowej ?

Session_destroy lub ręcznie wywalać wszystko z sesji.

Nie wydaje mi się aby można mieć dwie aktywne sesje, lepiej jednak unset użyć niż session_destroy (czasem nie wszystkie zniszczy)