Dobry wieczór,

Jestem nowym użytkownikiem a także początkującym w php, chciałbym prosić o poradę jak zapisać kolejność wierszy w tabeli do bazy danych, żeby po kolejnym odczycie ułożone były tak jak je zostawiłem.
Każdy <tr> posiada ID który jest ID w tabeli, kolejność jest zapisana w tabeli w kolumnie sort.

[PHP] pobierz, plaintext 
$line .= '<table name="items"><tbody>';
 
	$i = 1;
 
	while($file = $list->fetch_array()) {
 
		if($file['active']){
			$selected = 'checked';
		}else{
			$selected = '';
		}
 
		$line .= '<tr id="'.$i.'" class="item-data"><td width="5px">▲ ▼</td><td value="'.$file['order'].'"> ' .$file['file_name']. ' </td><td><input type="checkbox" class="tick" '.$selected.' value="'.$file['active'].'" id="'.$file['id'].'"/></td></tr>';
 
	$i++;
 
}
 
 
	$line .= '</tbody></table>';
[PHP] pobierz, plaintext 

ten kod generuje moją tabelkę.
Nie mogę zrozumieć, jak przygotować ajax i wysłać dane do php żeby zapisać nową kolejność.

Kolejność zapisu tak na prawdę nie ma znaczenia. Przy odczycie po prostu je posortuj "SELECT * FROM ... ORDER BY table.column {rosnąco/malejąco}"

Najpierw musisz wywołać jakoś ajax, a ten będzie wywoływany przy klikaniu strzałek /\ \/, trzeba więc tam podpiąć zdarzenia na click.
Kiedy sortujesz w górę, to ustawiasz dla rekordu wyżej klucz sortowania jak obecny, a obecnemu klucz sortowania z tego wyżej. Analogicznie przy sortowaniu w dół. Czyli zamieniasz klucze dwóch sąsiadujących rekordów.
Sąsiada nad i pod znajdziesz sortując ASC lub DESC rekordy i wybierając jeden rekord gdzie klucz sortowania > lub < klucz sortowania sortowanego rekordu.

Chyba prawie sobie poradziłem ale .... nie do końca bo:
Kiedy przesunę rząd np z początku na koniec tabelki zapisany porządek w DB jest jakby niepoprawny

i kiedy odświeżę stronę rząd który powinien być "teoretycznie" ostatni magicznie jest pierwszy, a czasem nawet drugi
i nic mi się nie zgadza
Już praawie wszystkie włosy sobie wyrwałem z głowy, tak mnie to irytuje
generuję nowy porządek w ten sposob:

[PHP] pobierz, plaintext 
		jQuery('tbody').sortable({
			axis: 'y',
			update: function(event, ui) {
				var newOrder = jQuery(this).sortable('toArray').toString();// efektem działania jest "lista"
// czy a jeśli tak, to jak zbudować tablicę np nazwa => wartość
// próbowałem tak: var newOrder = jQuery(this).sortable('toArray',{id: 'id'}).toString(); 
// ale najwyraźniej sortable toArray robi to po swojemu i nie interesuje "go" co ja tam sobie wymyśliłem ;)
 
				jQuery.ajax({
					url:	'updateCssList.php',
					type:	'POST',
					data: {
						'order': newOrder,
					},
					success: function(result)
					{
						console.log(result);
					},
				});
			}
		});
[PHP] pobierz, plaintext 

Nie wiem gdzie tkwi problem. Zapisuje dane w ten sposób:

[PHP] pobierz, plaintext 
if( isset ( $_POST ) ) {
		$myarray = explode(',',$_POST['order']);
		$i = 1;
		require_once 'config.php' ;
		if (!$conn) {
			echo 'Connection Failed';
			die("Connection failed: " . mysqli_connect_error());
		}	
 
		foreach($myarray as $item){
			$sqlNeworder = "UPDATE `tblCssList` SET `order` = '$i' WHERE `id` = $item";
			mysqli_query($conn,$sqlNeworder);
			$i++;
		}
}
[PHP] pobierz, plaintext 

Podpowiedzcie gdzie zrobiłem błąd, nie rozumiem dlaczego mimo, iż porządek jest generowany i widzę go w konsoli gdzie wygląda prawidłowo.

Mam bardzo podobny problem, to co jest na ekranie nie oddaje tego co jet przesyłane do php.
Wygląda jakby wysyłany był stan z "przed" wykonania ruchu.
np jeśli mam aktualnie 1,2,3 i zmienię 2,3,1 wysyła mi 1,2,3 a jeśli teraz wykonam ponowny ruch na ekranie przeciągając 1 na początek w konsoli widzę 2,3,1, czyli stan przed wykonaniem ruchu

Czytaj dokumentację.
sortable('toArray') domyślnie zwraca listę id elementów. Nawet kiedy podasz jako drugi parametr {attribute:'id'}, to i tak nic nie zmieni, bo wiersze nie mają nadanych id.

Tu masz przykład z użyciem innego atrybutu (data-sort). Możesz go zmienić na id (w html, a w js zmienić lub usunąć).
https://jsfiddle.net/khzcn586/