chciałbym aby w polu textarea pokazały się klikane elementy z bootstrap treeview aby uzyskać taki rezultat jak na zrzucie ekranu (drzewo procedur, a po kliknięciu wrzuca je do pola textarea).

działa to obecnie tak:
skrypt
ale w polu textarea nie mogę mieć diva z zawartością.jak to rozwiązać?

Generalnie to nie ma możliwości, abyś w polu textarea miał znaczniki HTML, które będą renderowane. Polecam, abyś przeczytał o parametrze "contentEditable", na przykład tutaj: W3Schools.

Takiego diva sobie przez CSS zrób, aby wyglądał odpowiednio. Co więcej, jeśli potrzebujesz tego pola, aby był przesyłany przez forma, to musisz utworzyć ukryte pole textarea, do którego parametru value będziesz JSem wprowadzał wartość z Twojego DIVa. Potem przesyłasz tylko textarea.