Witam, jestem początkujący w temacie i moje pytanie jest następujące??

jeśli mam np. zrobić menu to czy lepiej jest zrobić osobny plik np.menu.php i go includować
czy
zrobić np plik funkcje.php a w nim funkcję np. function Menu()
i potem tam gdzie jest miejsce na menu wywołać funkcję Menu();

Jak jest wygodniej, łatwiej, lepiej, i bardziej profesjonalnie??

czekam na wasze odpowiedzi
pozdrawiam

To zależy. Jeżeli w pliku funkcje.php (używanie polskich nazw jest nieprofesjonalne) będzie wiele funkcji, które nie będą wywoływane w większości przypadków to lepszy include. To tak samo jakbyś zrobił jeden plik ze wszystkimi funkcjami, szablonami itp. Jeżeli skrypt jest bardzo prosty - ok, to jest dobra forma, ale przy złożonych projektach trzeba brać pod uwagę transfer i organizacja pracy, a rozdzielenie skryptu na osobne pliki bardzo pomaga w organizacji.

PS Nie mieszamy warstwy HTML z PHP. Poczytaj o systemach szablonów.