Witam zwracam się do was z jednym pytaniem czy jest możliwość ingerencji zmiennymi w kodzie CSS. Np. jak zmienię wartość zmiennej z red na blue, to wtedy zmieni mi się kolor szablonu?

Raczej nie ale możesz to zrobić za pomocą GET

[PHP] pobierz, plaintext 
if ($_GET['kolor']==red) {
echo 'style="backgroud-color: red;"'; 
} else {
echo 'style="backgroud-color: blue;"';
}
[PHP] pobierz, plaintext 

Reszta w css i odpowiedni odnośnik w tekscie zawierający informację jaki kolor został wybrany np. index.php&kolor=red