Witajcie,
czy jest jakaś inna metoda,niż ta którą obecnie stosuję, a mianowicie:

plik index.php posiada jakieś załóżmy menu z linkami.
Każdy link jest obsługiwany przez jquery i ajax czyli, jak wszystkim pewnie wiadomo, klikamy w odnośnik i następuje załadowanie przy użyciu ajaxu nowej treści.
Pytanie teraz:
w index.php tworzę obiekt do obsługi bazy danych (oczwyiście required do pliku jest).
w ajaxie chciałbym wykorzystać zapytanie do bazy, ale nie mogę się odnieść do owego obiektu utworzonego w indexie.
Muszę ponownie w danym pliku AJAXu dawać odniesienie do pliku z klasą i definiować na nowo owy obiekt bazy inaczej dostaję:
Fatal error: Call to a member function getAll() on a non-object...

Jakieś propozycje ? Czy może jest to jedyne rozwiązanie i trzeba dopisywać za każdym razem ścieżkę i tworzyć tymczasowe obiekty ?

To wynika z natury skryptow - sa wykonywane i koniec, wszystko znika. Przed kolejnym wykonaniem skryptu wszystko trzeba zainicjowac na nowo. Mozna napisac system routingu + odpowiedni dla Ciebie autoload i za kazdym razem wywolywac index.php.

Jednak tak utworzone obiekty zawsze beda inne, jezeli zmienisz cos za 1 razem, to za 2 tej zmiany juz nie bedzie. Mozna zapamietywac stan obiektow (np. serializacja), ale chyba nie o to tutaj chodzi.

czyli, jak rozumiem, sposób w jaki to obecnie robię jest właściwy ?

Tak, jednak da sie to uproscic, ale potrzeba do tego troche wkladu pracy

To, że przy każdym żądaniu http tworzy się nowe obiekty to sprawa oczywista i tak to po prostu działa. Z Twojego opisu wnioskuje, że to co u Ciebie komplikuje sprawy to mało elastyczny projekt skryptu.

Czyli wygląda na to, że każdy plik zaczyna się całą masą require() żeby podołączać wszystko co może być potrzebne, a to jest słabe i sztywne rozwiązanie. Powinieneś do każdego pliku dołączać jakiś core.php, który będzie zawierał połączenie z bazą, metodę __autoload() i wszystko co będzie potrzebne będzie się automatycznie ładować.

http://php.net/manual/en/language.oop5.autoload.php

Do tego właśnie dążę. Bez sensu jest ciągłe przeklepywanie masy require (pomijając już estetykę i przejrzystość kodu).
Pomysł z autoload przyznam, że jest całkiem ciekawy.