Mam aplkacje napisaną w PHP moge tworzyć przy jej pomocy dokument w pdf-ie.
Jak zrobić żeby tworzył mi się też plik xml-owy

Wygenerowac go? Nie wiem w czym problem, xml to zwykly plik tekstowy, podobny do HTML'a

Jakiego kodu użyć żeby mi wygenerował oddzielny plik?

plik xml to zwykly string zapisany do pliku.

[PHP] pobierz, plaintext 
<?php
$zm = '<z1><z2>blabla</z2></z1>';
file_put_contents('plik.xml', $zm);
?>
[PHP] pobierz, plaintext 

Ale takie rzeczy to na przedszkole a nie na xml

Przenoszę na Przedszkole.