Mam napisany skrypcik ktory za pomoca biblioteki HTML2FPDF tworzy mi PDF'a. Orientuje sie ktos, czy pod generowanego pdf'a mozna wczytac szablon z innego pliku PDF (np. pusty blankiet wplaty w PDFie i na niego nanosic wpisy) ?

Wydaje mi się ze najlatwiej osiągnąłbys ten cel, NIE wgrywając innego PDFa, a nie możesz zrobić tak ze weżmiesz zrzut ekranu czy skan takiego blankietu wrzucisz to jako background do jakiegos DIVa, poustawiasz ładnie pola w odpowiednich miejscach odpowiadające kwocie przelewu, tytułowy przelewu etc - i wszytsko w temacie?
odrazu mówie że mogę sie mylić bo dotychczas używałem innej metowy generowania PDFów i nie znam w pełni możliwości i ograniczeń funckji HTLM2PDF

Nie, jak nazwa wskazuje jest to HTML2PDF, a nie PDF2PDF.