Czy da się za pomocą CSS i HTML zrobić własny wykląd suwaka bo mam na stronie liste z suwakiem i jego defaultowy wygląd nie pasuje do reszty.

http://css-tricks.com/custom-scrollbars-in-webkit/

Tak ale to działa chyba tylko IE. A gdyby użyć tu JavaScript?

Ciężko wejść w DEMO przeglądarką inną niż IE i samemu się przekonać?
http://css-tricks.com/examples/WebKitScrollbars/

chyba chciałeś powiedzieć nie działa w IE, na co wskazuje sama nazwa WebKit. Pytanie poco, to tylko zbędny ficzer tak jak śnieg na stronie i inne eksperymenty A IE rządzi się własnymi prawami.