W epoce przed poznawaniem Smarty robiłem w pliku index.php kilka includów, z których np. jeden wyciągał artykuły z bazy danych.

Teraz mam plik index.php, który uruchamia index.tpl. W index.tpl mam layout strony i statyczny tekst includowany z menu.tpl. Chcę dołączyć fragment kodu z SQLową instrukcją SELECT. Zapisuję ją w pliku art.php. Czy dobrze rozumiem, że powinienem utworzyć wykorzystujący go art.tpl i zaincludować go do index.tpl tak jak kod statyczny?

Nie wiem czy dobrze zrozumiałem, ale:
w index.php includujesz art.php, to co zwrócą funkcje w art.php za pomocą metody assign() w smarty przekazujesz do szablonu, w index.tpl robisz include art.tpl i masz to co chciałeś

Niekoniecznie możesz pobrać dane zapisać w tablicy a do szblonu smarty przekazać tablice smarty ma własne pętle do przetwarzania tablic