Jak zapisuje ścieżkę do pliku w bazie to wycina mi znaki '\', jak zrobić żeby zapisywała sie ścieżka poprawnie czyli np: c:\pliktxt a nie c:plik.txt?

Możesz przed zapisem skorzystać z funkcji urlencode a po wyciągnięciu z bazy spowrotem go dekodować funkcją urldecode

Bądź przez base64.