http://jsfiddle.net/WNztV/

Chce uzyskać efekt zatrzymania się przewijania zakładek gdy kliknę na którąś. Dlaczego gdy setInterval przypiszę do zmiennej aby ją usunąć, przewijanie zatrzymuje się na drugiej pozycji?

Dlatego, że na nowej zakładce wywołujesz wydarzenie "click", które czyści interwał.

Czyli nie wywołuj zdarzenia click, tylko usuń klasę "on" z poprzedniej zakładki i dodaj ją do nowej w funkcji interwału.