Dziwna sprawa...
1) W formularzu mam ponad 2000 checkboxów o atrybucie name="example[]"
2) Wysyłam forma
3) W odbieranym skrypcie $_POST[example] ma tylko 997 elementów
Co więcej, Firebug pokazuje, że w HTTP szło wszystko.
Skrypt się sypie w środowisku z PHP 5.3. W innym środowisku z 5.2. śmiga...

Orientujecie się, co może być przyczyną ucięcia tablicy?

może pokażesz kod

Jeśli masz możliwość to porównaj wartości dyrektywy post_max_size w obu środowiskach tj. PHP 5.2.... i PHP 5.3.... Może w tym tkwi problem.

EDIT
Oczywiście szukaj w php.ini.

Warto też sprawdzić dyrektywę upload_max_filesize

max_input_vars