Użyj count_chars(), potem sprawdzasz czy w tablicy jest wartość większa niż dwa, wtedy usuwasz wiersz
if($val > 2){
//usuń wiersz
}
}
Jeśli chcesz sprawdzać tylko litery i cyfry to wtedy sprawdzasz dodatkowo klucze z kodem znaków, zależy jakie kodowanie jest ustawione.
A jeśli chodzi tobie o powtarzające się znaki jeden po drugim to można zrobić przy pomocy wyrażeń regularnych.