Czy da się jakoś wykrywać ze jakiś obiekt zmienił swoją zawartość przez przypisanie mu innej przez metode innerHTML.
Czy tam o jakimś window.addEventListener ale nie wiem czy tedy droga oraz jak ograniczyc lisnera do konkretnego obiektu np. jakiegoś div`a?

Dobrze się nakierowałeś, ale to ponoć nie działa w IE (tam jest bodajże AttachEvent).
Znalazłem takie coś http://developer.mozilla.org/pl/docs/DOM:e...ddEventListener