Ciąg znaków to tablica. Za pomocą indexOf sprawdzasz czy ciąg zawiera przecinek. Jako, że to tablica sprawdzasz czy dwa kolejne liczby istnieją i wykonujesz odpowiednie operacje...
Jednak domyślam się, że chodzi o coś innego. Skonwertuj liczbę za pomocą parseFloat( zamieniając "," na "."), później ustal precyzję( *100->round->/100), później znowu "." na ",".
Ew. skorzystaj z gotowca:
http://www.google.pl/search?q=js+money+val...lient=firefox-a -> w USA używa się kropki zamiast przecinka( przynajmniej jeśli chodzi o programowanie )