Witajcie
Tak jak w temacie, jakim sposobem mam ukryć dany plik na FTP, mam dostęp do roota itd, jest to serwer VPS, i chce ukryc dany plik dla użytkowników FTP.

Zależy, jakiego demona używasz.

ProFtpD to jest serwer a klient to File Zilla

Jesli plik jest wewnatrz katalogow dostepnych dla usera to mozesz dac mu chown na innego usera, ustawic chmod na 0600 i nikt poza tamtym userem go nie odczyta (jego tresci).
Jesli nei chcesz zeby byl widoczny - to wrzuc go do katalogu, katalogowi nadaj chmod 0700 i nikt nie zajrzy do katalogu, oprocz wlasciela katalogu.

Te operacje robisz oczywiscie z root'a