Ja wiem że to będzie bardzo łatwa odpowiedź ale mam problem ze zrozumieniem foreach. W bazie mam kategorie produktów o strukturze

[PHP] pobierz, plaintext 
[ id ][ id_parent ][ nazwa ]
[PHP] pobierz, plaintext 

Listuje sobie to tak:

[PHP] pobierz, plaintext 
<?php foreach($this->katalog as $katalog){ ?>
 
	<td class="center"><?php echo $this->escape($katalog->id);?></td>
	<td class="center"><?php echo $this->escape($katalog->id_parent);?></td>
 
<?php } ?>
[PHP] pobierz, plaintext 

Chciałbym wykorzystując to jedno zapytanie zabronić usuwania kategorii jeśli posiada subkategorię. Wiem że trzeba będzie napisać drugie foreach żeby sprawdzało czy dla danego $katalog->id istnieje subkategoria z $katalog->id_parent.

Są dwa wyjścia. Pierwsze - dodajesz na stałe w bazie pole które trzyma liczbę potomków danego węzła (np. desc_count). Musisz je aktualizować przy każdym usunięciu/dodaniu węzła potomnego. W drugim rozwiązaniu generujesz sobie to pole w czasie zapytania SQL np.

[SQL] pobierz, plaintext 
SELECT id cur_id, (SELECT COUNT(*) FROM tabela WHERE id_parent=cur_id) desc_count FROM tabela
[SQL] pobierz, plaintext 

W obu dostajesz w każdym wierszu liczbę potomków (pierwszego poziomu). Jeśli liczba jest większa niż 0 to blokujesz usunięcie.

Drugi sposób nie zamuli jak będzie 1000 kategorii i 100000 podkategorii?

Musiałbyś sprawdzić. Na moim malutkim zbiorze (50 rek) różnice pomiędzy zwykłym selektem a zagnieżdżonym są pomijalne. Przy większych lepiej trzymaj to pole statycznie.