HTOP wyświetla mi mnóstwo procesów mysql.
Po restarcie wracają jak bumerang tak więc chciałbym poznać ich przyczynę albo przynajmniej źródło.
Jak zobaczyć chociaż którego użytkownika na serwerze dotyczą te procesy albo chociaż jakieś nazwy baz danych, tabel?

W /proc nie widzę większości procesów.

htop w odróżnieniu np. od ps pokazuje Ci procesy włącznie z ich wątkami (jak naciśniesz F5 pojawi Ci się widok "drzewiasty"). Aby zobaczyć czym się aktualnie zajmuje baza, możesz wykonać w bazie polecenie

[SQL] pobierz, plaintext 
SHOW FULL processlist
[SQL] pobierz, plaintext 

Biblioteki PD chyba nie mam zainstalowanej. Jakieś inne opcje?

Co do tego zapytania spróbowałem go bezpośrednio w PHPMyAdmin - działa ale pokazuje jeden proces i dla aktualnego użytkownika.
Pewnie go trzeba odpalić bardziej globalnie, np. na serwerze?

Coś w ten deseń (wole się upewnić)?

Nie rozumiem

Najlepiej wykonaj je jako superuser (najczęściej użytkownik root) w mysql, to wtedy zobaczysz wszystkie procesy.

Sorki, literówka. Chodziło o ps-.