Jaka komenda spakowac wszystkie katalogi wraz z plikami i subkatalogami ?

Mozesz uzyc funkcji w php lub wywolac polecenie systemwe exec('tar -zcf .......)

php odpada

Istnieje komedna ZIP ale ona pakuje albo tylko dany katalog, albo katalogi bez plikow, a ja bym chcial wszystko

man tar - pisze wszystko, wystarczy poczytac

Przecież SongoQ udzielił Ci już poprawnej odpowiedzi. Dla formalności podam całą składnię (którą ja np. stosuję):

tar -czf nazwa_archiwum.tgz /sciezka/do/katalogu

Spakuje Ci cały katalog "katalogu" ze wszystkimi plikami i podkatalogami wgłąb.