Na stronie PHP mam zadeklarowaną funkcję np.

[PHP] pobierz, plaintext 
<?php
function licznik ($id)
{ tutaj następuje inkrementacja odpowiedniego pola licznika w tabeli
   w rekordzie określonym zmienną $id;
}
?>
[PHP] pobierz, plaintext 

Na tej samej stronie są hiperłącza do podstron.
Chciałbym aby po kliknięciu na dany link wywołana została w/w
funkcja i jednocześnie przekazana była do tej funkcji wrtość $id.
Funkcja ta powinna wykonać się po kliknięciu na link ale zanim
przeglądarka opuści aktualną stronę.

Ma to być licznik kliknięć w linki.

Przypuszczam, że można tu zastosować java script, onclick, czy ktoś
ma jakieś pomysły.

Musisz zwrócić uwagę na fakt, iż PHP jest wykonywane po stronie serwera, a więc onClick tutaj nie będzie pomocne bo javascript nie widzi tej funkcji, a tym bardziej nie wie jak ją wykonać.

Takie liczniki zazwyczaj rozwiązuje się np:

[PHP] pobierz, plaintext 
<?php
$url = mysql_escape_string($_GET['url']);
$sql = "UPDATE `linki` SET `licznik` = `licznik`+1 WHERE `link` = '$url'";
mysql_query($sql);
header('Location: $url');
?>
[PHP] pobierz, plaintext 

Powyższe rozwiązanie bazuje na tabeli z polami (`link`, `licznik`) i zakłada że każdy link ma swój rekord minimum z wartością licznika ustawiona na zero.
Nie jest to idealne, gotowe rozwiązanie ale chyba w wystarczającym stopniu rozwiąże Twój problem.